二零一六年七月二十六日下午三点，吕慧芝在宜良发真相资料，被便衣绑架、抄家后送昆明市看守所。家属为她请了当地律师为她辩护。

二零一七年一月底，得知吕慧芝已被秘密开庭，非法判处有期徒刑三年。现已被送往云南第二女子监狱。

吕慧芝在看守期间，专门迫害法轮功的“610”和公安陪着她的爱人去看了她，爱人拍摄了家里老人离世后家中境况及女儿哭泣着哀求她“转化”（放弃信仰）早日回家等视频放给她看，希望他能配合公安和“610”。

吕慧芝在“610”威逼亲人制造压力或扣去退休工资的威胁下，仍然坚持不愿改变自己的信仰。

吕慧芝关爱自己的亲人，她只是行使宪法赋予的言论和信仰的权利，就被中共关入冤狱，而专门迫害法轮功的“610”特务组织却威逼她的家人给她施加压力，是“610”在撕裂亲情，破坏人伦道德。