卢爻穴被迫害后，身体状况一直不好。二零零九年八月三日检查出卢爻穴患有高血压伴有脑梗塞。狱方要求卢的家属出看病的钱。卢的家人知道后去祁县监狱看望时，就看见他由旁人搀扶着走，因为一条腿和一只胳膊已经失去了知觉。

卢的儿子孝顺，心痛亲人就买了辆轮椅送到监狱，又以病人生活不能自理，应让家人照顾为由，书面要求放人，监狱一直不批。之后又将卢爻穴转到太原市109医院（也是监狱医院），诊断为脑出血。据卢说，在109医院，没人管，两天都吃不到饭，喝不到水。家人多次提出要求：放了人，由家人来照顾。但狱方管教说：死就死了，死的人多着呢！卢看病看了不到二十天，却越看越严重。

后来家属到监狱要求见亲人，狱方推托不让见病人。而且家属每次去看望时，监狱都向家属勒索给病人看病的医药费。终于十二月十一日，才把卢爻穴从太原的医院接回家中，当时人已起不来了，说话费力，二零一零年一月九日，卢爻穴不幸离世。