二零零九年八月十七日，孙玉芹与同村法轮功学员去红旗镇讲真相，被红旗派出所鞠春波、王国军等几名警察绑架。警察把孙玉芹关在红旗派出所的一个房间里，拿来一张纸，让孙在上面签字，孙玉芹要看内容是什么，其中一个姓张的恶警随即踢了她一脚，让她赶快签字。孙玉芹向警察讲真相，希望他们能多了解法轮功。警察不但不听，还无理智的对孙玉芹拳打脚踢，不一会，孙玉芹被打得动不了了。孙玉芹向警察喊：“我要回家，你们是非法的，而且是执法犯法！”其中一个警察瞪了孙玉芹一眼，说只要签字就放人。孙玉芹没有配合他们，警察便去孙玉芹家，让孙玉芹不识字、更不懂法律的丈夫签字，威胁并欺骗说只要签字就放人。孙老实的丈夫相信了他们的谎言和欺骗，便签了字，没想到，不但没放人，当晚孙玉芹就被秘密送到丹东看守所。

孙玉芹被关在丹东看守所一个二十多平米的破房子里，有二十多人同住，每天吃喝、大小便都在一个房间里，这边正在吃饭，那边上厕所，上厕所的时间有规定，过了时间就不让去，有时还派两个人看守。每天吃的只给一碗米汤，吃不饱不说，还要起早干活，干不完就不给饭吃，还不让睡觉。看管人员一不顺心，就毒打法轮功学员，其中有一个叫王静的恶警，手段更加残忍。

二零零九年十月二十三日，孙玉芹被秘密送到沈阳马三家劳教所。劳教所警察白天黑夜的逼迫孙“转化”（监狱强迫法轮功学员放弃信仰，称之为转化），也没有达到目的。“犹大”（中共称之为“帮教人员”）袁淑珍叫恶警于小川，把笔强塞入孙玉芹手里，让孙玉芹签字，孙玉芹不签。

劳教所把坚定的法轮功学员送到洗脑班。法轮功学员孙福弟在洗脑班说了一句“法轮大法是正法”，就被送到“东港”（专门迫害法轮功学员的黑屋）里秘密进行迫害。警察让孙福弟站在一块砖头上，让专人看着，一动不许动，动就打。还强迫她踩着法轮功师父的法像和书，不踩就毒打。孙福弟不久被折磨的起不来了，恶警还强迫她干活，不干就打。不久孙福弟出现了生命危险，被送到沈阳医院检查。

还有一名法轮功学员李锦秋被张环为首的恶警强行劈腿，致使李锦秋的腿碰一下就象荡秋千似的乱荡，站着非常困难，就这样还被恶警强行拉去车间奴役。

孙玉芹学大法前是一身病，并且婆媳关系很不好，经常因家庭琐事闹矛盾。通过一段时间学法修炼，大法的“真善忍”的法理在逐渐改变她，她不但身体康复了，性格也变得宽宏大量，不再计较过去的恩怨得失，主动跟婆婆和好，从此悉心侍奉老人，一家人过得快快乐乐的。

然而，在孙玉芹被非法关押的一年多里，她年迈的母亲因为担心焦急，含冤离世。孙回家后还被当地派出所警察多次无理骚扰，警察倪成民等恶警还强迫孙玉芹签字、照像。