二零零零年二月，冯玉秋到北京为法轮功鸣冤，在离天安门不远的地方就被北京警察绑架，用警车拉到天安门附近的公安分局，后被送到吉林驻京办事处。她身上带的一百五十元钱被一女警察抢去。两天后她被劫持到舒兰拘留所非法拘留五天，然后才被学校负责让人接走。在此期间，她还被七里派出所警察勒索一千五百元，当年夏天又被教育局以“抵押金”名目骗去三千五百元。

二零零零年十二月十九日，冯玉秋再次到北京，在天安门金水桥上她和其他法轮功学员一起打出“法轮大法好”的横幅，高喊“法轮大法是正法”，被北京警察绑架到天安门附近的公安分局，法轮功学员们仍拉着横幅，喊法轮大法好，警察举起警棍大打出手，当时就把冯玉秋的头打起一个大包。据冯玉秋后来说，她还看到有一位女法轮功学员被打得鼻口出血，另一位女法轮功学员紧紧攥着横幅不放，被警察拖走，不知弄到什么地方去了，地上留下她斑斑血迹。

后来冯玉秋等法轮功学员被拉到北京市区的派出所，警察逼她们强行照相，不照就打，逼说出姓名，否则就不让睡觉；稍后在北京城区看守所，冯玉秋被强行灌食，警察打她的嘴、踩住她的脚，用拳头打她的头部，强行灌入浓盐水，更多时候，是用塑料管插入鼻孔进入食道，冯玉秋的鼻子、嗓子都被插出血。

三天后，冯玉秋被拉到河北省的井陉县公安局，遭酷刑折磨，两男一女警察用电棍电冯玉秋的脸、耳朵、手，逼她跪着，把她的双臂扭到后边去，使劲往上抬；把木棒放在她的小腿肚子上，两个警察上去狠命踩压，象擀面饼一样来回踩压，直到她的脚和腿被踩的肿到了极限，他们打累了，就停下来喘粗气。过一会儿又继续用这种酷刑折磨她，直到说出姓名为止。冯玉秋腿肿的象杠子一样，不能弯，不能走，两个多月才消肿。直到现在，她的左脚大拇趾和二趾站立、行走都伸不开。后冯玉秋被非法劳教一年。

在长春黑嘴子劳教所，冯玉秋受尽了精神和肉体折磨。为了逼迫她写“五书”，警察、邪悟者轮流对她进行围攻洗脑，不许睡觉，逼迫“转化”。

劳教所还每月强迫法轮功学员写思想汇报，不合劳教所胃口就逼重写，用这种方法给大法学员洗脑。还经常逼看诽谤法轮大法的电视片，举行所谓报告会、升旗仪式、签名等，逼迫法轮功学员背叛“真善忍”信仰。另外，每天还强迫法轮功学员做十几个小时的奴工。

一年非法劳教到期时，管教安排三大队八个邪悟者把冯玉秋带到一个房间恐吓、威胁，逼迫她“转化”，冯玉秋坚决不肯，被恶徒狠狠打耳光。

冯玉秋回家后，仍继续遭中共人员的骚扰。二零零二年夏天，舒兰市“六一零”和教育局的温长吉等四人闯到二十五中学找冯玉秋，说教育局有一个“转化”名额，逼她“转化”。遭到冯玉秋断然拒绝，她说：“我修真、善、忍做好人，让我往哪里‘转化’？我不干！”

二零零七年，冯玉秋再次被绑架到洗脑班。那年八月十一日凌晨四点，舒兰市七里乡二十五中学校领导张殿全、杨光伟、周某、郝树江、胡鹏彦等和七里派出所警察张黎闯到冯玉秋家，强行把她劫持到吉舒镇响水水库（故乡福利院）洗脑班。当时被绑架到洗脑班的法轮功学员有十四人。“六一零”人员令长春某派出所警察王玉兰、邪悟者祝某（男，四十多岁）、舒兰的李合举、吉林市史某（男）给法轮功学员进行洗脑。冯玉秋拒绝转化，最后被罚款一千元。