昌吉劳教所部分罪行如下：利用劳教所恶人殴打并侮辱新被绑架入所的法轮功学员。利用两名劳教人员24小时监控管制法轮功学员。利用高强度劳动进行人身迫害，如每天劳动达20小时之多，经常通宵达旦，睡眠严重不足；干活期间叫骂声、耳光声、砖头砸背声没一刻停歇，充当打手的是干警培养的劳教组长，最后由干警用电棍总结。

2001年1月，一批法轮功学员公开表示坚修大法到底。之后劳教所便开始打击报复坚定的法轮功学员，如用电棍殴打法轮功学员；当众拉出法轮功学员干苦活及重活；进行强制洗脑的精神迫害；挑动包夹监控仇视从而迫害法轮功学员。

2001年11月25日，几十名法轮功学员绝食罢工，抗议劳教所迫害。劳教所对这些学员用电警棍、手铐等刑具镇压，唆使其他劳教人员拳打脚踢进行灌食。

昌吉劳教所迫害法轮功学员的主要责任人是所长朱雪飞，参与打人的部分干警有六大队的顾建海、宁涛、田虎、警戒队的张彦。

昌吉劳教所的所有法轮功学员（均为男性）都可以作为见证人。部分学员名单如下：崔贵林，范勇林，王辉，赵爱军，李先正，周旭东，李阳，刘宇霖，王立丰，刘志军，钟凯，郭树岩，李永平，刘新平，葛利军，麻巨军，陈玉江，蔡文旭，樊大成，徐军年，宋继庄，南纬，王宏军等。