现任第十届全国政协主席的贾庆林，在1999年-2002年任北京市委书记时，积极推动参与对法轮功学员的迫害；其在京任职期间，是北京对法轮功学员迫害最疯狂、残酷的时期。北京工商大学青年教师赵昕，和梅玉兰、龚宝华、张淑琪等都是在这期间在北京被迫害致死、“天安门自焚构陷案”亦是在此期间发生的。

贾庆林是被“追查迫害法轮功国际组织”追查的11个直接参与推动对法轮功学员的迫害的中共中央官员之一。

据“追查迫害法轮功国际组织”调查，贾庆林长期以来被认为是江泽民的亲信，在著名的“远华案”中被江力保而得以“过关”。贾在政治上紧跟江泽民的镇压法轮功政策，1999年7月20日江氏开始镇压法轮功，贾立刻表态支持并召开市委常委扩大会议，要求全市各级党组织和全体党员要旗帜鲜明、态度坚决地投入这场政治斗争中。

贾庆林在政协和人大会议期间多次反复强调和法轮功的“斗争”并利用一切机会攻击法轮功，他率先会见全国“反法轮功巡回报告团”为之打气，还出席北京市“同法轮功斗争先进表彰会”并讲话鼓励那些直接参与迫害的单位和个人，贾还具体操纵北京市对法轮功问题的“调查研究工作”。此外，贾庆林还在各种会议和场合攻击法轮功，如北京市政法工作会议、宗教工作会议、北京市党代会、慰问公安干警和商业战线干部职工等。在北京市迎接十六大动员会上，他提出把迫害法轮功作为北京市必须重点抓住五个方面的工作之一。他还积极参与对法轮功女学员的迫害。在贾庆林担任政协主席后主持政协工作的第一次会议，即全国政协十届一次会议开幕式上，政协副主席李贵鲜作报告就打破了李瑞环主政时的传统，加进了攻击法轮功的部分。