1999年大法遭迫害后，学校和派出所多次施压要他放弃对真善忍的信仰，他因此于2000年被迫离校，漂泊在外。2001年12月在广西梧州资料点被抓，广州公安为推卸责任没有将他接回。当地610对其威逼利诱，吴志均拒不妥协，被非法判8年，已送往广西桂林监狱。中山大学党委竟落井下石，声称因文件只规定法轮功学员被劳教者不许开除，现在吴老师是劳改，可以开除。

吴志均的母亲吴玉娴与他同时被抓，老人家60多岁了，是中山医肿瘤医院退休护士，也被非法送劳教两年。吴志均的弟弟与弟媳也被非法判劳教，分别关押在广州花都一所和槎头女所。吴志均一家因信仰真善忍而遭到江氏流氓集团的残酷迫害。