劳教所组织了由六队指导员顾建海、副大队长宁涛、田虎负责，挑选了几名多次劳教过的“老改造”马德海等犯人充当打手，组成所谓的“转化工作小组”，他们的“转化工作”就是体罚、毒打、电击、威逼利诱。新被绑架入所的大法弟子徐健、王建平、蔡文旭等就在入所的头一个多星期里多次遭到马德海、牟江等打手们的毒打、折磨，大法弟子陈玉疆被副大队长田虎指使的几个值班劳教犯人毒打致伤，胸部咳血，早晨起床都十分困难，连续疼痛几个月。大法弟子麻巨军、柳岸红等也遭到过恶警及劳教犯人打手的殴打。

2001年11月25日，由于一个叫卡米力的劳教组长又在工房殴打大法弟子刘宇霖，致使多名大法弟子一起站出来表示抗议，并要求向劳教所反映情况。闻讯赶来的管教科长张彦不问事由，气势汹汹地说要枪打出头鸟，将刘宇霖拉进办公室殴打、电击。劳教所政委朱XX赶来后，又下令将站出来抗议的大法弟子分散，进行逐个镇压，还给大法弟子按上“哄所闹事”的罪名。因为这次集体抗议，使以前被迫写了“悔过书”的三名大法弟子又清醒过来，重新走上修炼的道路，使劳教所所谓“转化”工作彻底失败。恶警又气又恨，将刘宇霖、赵爱军、麻巨军、柳岸红等7人分别非法加期100天和120天不等，并将大法弟子麻巨军、柳岸红铐在床上折磨达4个月之久。

2002年9月，由于一队指导员殴打大法弟子刘志军、崔桂林，致使大法弟子崔桂林在升旗时表示抗议，五队、六队一些大法弟子也站出来抗议，劳教所立即进行镇压，从四队、九队调来3名恶警（陈江等），对大法弟子郭树岩、钟凯等进行殴打、电击，并将大法弟子赵爱军铐在地上20多天，大法弟子宋巨庄、陈玉疆也遭到殴打。

在一次电视台记者来采访时，大法弟子陈玉疆因说了一句“你们一定要真实报道啊”，在记者走后，管教科长张彦就将陈玉疆拉进办公室电刑拷打。由于劳教所执法违法的事干得太多了，他们就更加害怕被外界知道。在有检查团、参观团来时，就将大法弟子们藏起来，不让大法弟子们与这些人见面，并且数月不让大法弟子与家人见面。

在昌吉劳教所这个全疆唯一的所谓“部级文明劳教所”，没有身在其中经历过的人根本无法想象这里警察的卑劣和腐败，仅举其中几例：有的警察受贿后给劳教犯人代买白酒、啤酒，并与他们一起喝的醉醺醺的。有的队领导专门找几个劳教组长替他们敲诈劳教犯人的钱财，每次少则一、二百，多则四、五百，长期给他们上贡。在他们的默许下，海洛因、麻烟也时常能带进来，致使在有些大队吸毒成风。有的队领导本人也吸毒，并发生将妓女带进其宿舍留宿的事。在劳动任务较重的大队里，劳教犯人被迫进行超负荷工作，一般每天十六、七个小时，活紧时有的人一个星期都回不了宿舍睡一次觉。由于过度疲劳，手慢或出错而完不成任务的，就会被组长毒打，被警察用多根电棒电击，有的劳教犯人被组长毒打至吐血，其残忍与黑暗可见一斑。